Eu pensava que o Windows Live Messenger fosse compatível com todos os sistemas operacionais até quando fui colocar o MSN no Windows Server 2003 e não é compatível e no site ou em qualquer lugar que procurar não tem nada compatível, enfim achei uma solução através de um programa que mudando os parametros, configura o instalador e pronto.
Clique aqui para fazer o download do windows live messenger para o windows server 2003, obs, não sei se funciona no windows server 2008, não tive como testar, mais é quase certeza que funcione.